A Flores presta serviço de transporte coletivo de passageiros e opera nos municípios de São João de Meriti, Nilópolis, Duque de Caxias, Nova Iguaçu, Belford Roxo, Itaguaí, Campo Grande, Barra da Tijuca e Rio de Janeiro. A empresa está organizada em quatro áreas de operação, chamadas de unidades de negócios:
| Unidades de Negócios |
N°. Linhas |
Municípios Envolvidos |
| 1 |
11 |
São João de Meriti - Duque de Caxias - Nova Iguaçu - Belford Roxo |
| 2 |
13 |
São João de Meriti - Duque de Caxias - Rio de Janeiro - Campo Grande - Itaguaí |
| 3 |
13 |
Rio de Janeiro - São João de Meriti - Nilópolis - Belford Roxo |
| 4 |
18 |
São João de Meriti - Rio de Janeiro - Belford Roxo - Barra da Tijuca |